陈修园考取秀才后,进了当时福建的第一学府鳌峰书院读书在鳌峰书院读书期间,陈修园还遇到了一生中第一位真正医学导师,他就是鳌峰书院的山长(校长)大学问家孟超然。孟超然也是一位中医迷,两人经常在一起谈医论道,陈修园的儒学、医学齐头并进,整个书院时光是相当充实的,但是,或许是痴迷于医学过了头,陈修园的科举之路似乎进程缓慢,乡试考举人(秋闹),偏偏一直到36岁还没考上,闲暇时间陈修园还是一边读医一边读儒,他说:“文章报国,尚挟时命而行,而能为良医者,随在可以活人,诚儒分内事也”1792年,39岁那年,陈修园终于中举。